间充质干细胞和脐带血干细胞的区别多数来源不同、用途不同、治疗疾病不同等区别，要遵医嘱使用。
间充质干细胞来源于新生儿脐带组织，通过培养得到。脐带血干细胞多数来源于胎盘和脐带血液。
间质干细胞有较高的分化能力和免疫调节功能。脐带血干细胞有利于造血功能恢复，以重建人体免疫、造血系统功能。
间质干细胞多数可以用于治疗免疫性的疾病，比如系统性红斑狼疮或是皮肌炎等疾病。脐带血干细胞可以治疗自身免疫性溶血性贫血，血液系统疾病。
除此以外，还包括用途不同、治疗效果不同、皮肤效果不同等区别，需要定期到医院检查身体。
